地下降。亲鱼的主要产地洞庭湖大面积退缩，致使长江产卵场的亲鱼主要依赖于鄱阳湖，因而天然鱼苗的量和质都有所降低。人工近亲繁殖的退化后代，由于洪水或鱼池漏溢而部分返回自然产卵场，将退化了的遗传因子带入自然繁殖群体，这将导致天然基因库的破坏。
　　近年来利用细胞遗传工程培育的多种品系间杂交的鲤鱼养殖品种，其子一代表现出杂交优势，但在二代、三代却出现了较亲本更差的退化现象。这些杂交鲤在大水体放养或由池塘逃逸到江河、湖泊，又导致鲤鱼基因库的破坏。近几年来，鲤鱼的自然地方种群，包括黄河鲤等名贵品种的资源都在逐渐消失。因此在人类的生产活动中要努力减少对遗传多型性的破坏和对遗传规律的改变，以达到保护自然种质资源的目的

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