前肠、中肠、后肠三段，轻轻去掉肠道中的食物和粪便，然后进行观察。绦虫、吸虫、线虫等比较大的寄生虫，很容易就能看到；如果是肠炎，则会发现肠壁发炎、充血；如果是球虫病和粘孢子虫病，则肠道中一般有较大型的瘤状物，切开瘤状物有乳白色浆液或者肠壁上有成片或稀散的小白点。
（二）鱼病的镜检
用显微镜、解剖镜、放大镜对鱼病进行检查，简称镜检。镜检是在鱼病情况比较复杂，仅凭肉眼检查不能作出正确诊断而作的更进一步的检查工作。在一般情况下，鱼病往往错综复杂，很多病原体又小，除一些较明显、情况又较简单，凭目检可以作出有把握的诊断外，一般都有必要进行镜检。
检查时应注意的事项:
（1）要用活的病鱼或刚死的病鱼进行检查。由于鱼死亡后，寄生虫很快随之死去，寄生于鱼体的病原体又非常微小，死后往往很快改变形状或腐烂分解，因此时间稍长就很难确定其病原体。
（2）取样时要保持病鱼鱼体湿润。因鱼体干燥后，寄生在病鱼体表的寄生虫会同时被于掉，甚至连病鱼的症状也会变得不明显或无法辨认。因此，应将病鱼装在带有原饲养水的桶或盆里拿出检查。
2.检查方法
（1）载玻片法适用于低倍镜或高倍显微镜检查。方法是取下一小块病灶组织或一小滴内含物，放在干净的载玻片上，滴入一小滴清水或盐水，盖上盖玻片，轻轻地压平，先在低倍显微镜下检查，分辨不清或可疑的可再用高倍镜检查。
（2）玻片压缩法·用两片厚度约为3～4毫米，大小约6x12cm的玻片，先将要检查的组织或者是器官的一部分以及粘液等，放在其中一片玻片上，滴上适量的清水或盐水（注意体表部分或粘液用普通水，体内器官或组织用0.56%的盐水），用另一片玻片将其压成透明的薄层，即可放到解剖镜或低倍显微镜下检查。
3.应该重点检查的组织器官鱼的各个组织器官、血液都可能有病原体的寄生，但在生产实践中，特别应该重点检查的部位是粘液、鳍条、鳃、肠胃、肝脏。
（1）粘液在鱼的体表粘液中，除了肉眼可见的较大型的寄生虫和病症外，往往有许多肉眼看不见的病原体，如颤动隐鞭虫、口丝虫、车轮虫以及吸虫囊蚴等，粘孢子虫和小瓜虫的孢囊肉眼也不易区分。在检查时，先用解剖刀刮取鱼体表的粘液，然后按照镜检方法将粘液放到显微镜或解剖镜下观察。
（2）鳃检查鳃，可先用剪刀剪取一小片鳃组织，放在载玻片上，滴入适量的清水，盖上盖玻片在显微镜下观察；然后刮取鳃片上的粘液或可疑物，同样按上述方法进行检查。鱼的鳃是特别容易被病原体侵袭寄生的部位，细菌或寄生虫性.烂鳃、鳃霉、鳃隐鞭虫、粘孢子虫、微孢子虫、肤孢虫、车轮虫、斜管虫、小瓜虫、半眉虫、舌杯虫、毛管虫等原生动物，指环虫、三代虫、双身虫等单殖吸虫，复殖吸虫囊蚴，软体动物的幼虫以及鳋类等，在鳃上往往都会寄生。为了检查的准确性，每边的鳃至少要检查两片以上，取鳃组织时，最好从每一边鳃的第一片鳃片接近两端的位置剪取一小块，寄生虫大多在鳃小片的这两个位置上有寄生。
（3）肠胃检查肠胃，首先应把肠道外壁上所有的脂肪组织尽量去除干净，不然在检查时，脂肪进入肠道内的检查物，不易进行观察。脂肪去除后，一般是先进行肉眼检查，观察肠道外型是否正常，若肠道外壁上有许多小白点，通常是粘孢子虫或微孢子虫的孢囊。肉眼检查完后，一般是将肠道分为前肠、中肠和后肠三段，分别进行检查。胃肠道也是最容易受细菌和寄生虫侵袭的地方。除了引起肠炎的细菌外，其他很多寄生虫如鞭毛虫、变形虫、粘孢子虫、微孢子虫、球虫等原生动物以及复殖吸虫、线虫、棘头虫、绦虫等都可经常发现，有时数量还相当大。复殖吸虫、绦虫、线虫和棘头虫，通常寄生在前肠（胃）或中肠；六鞭毛虫、变形虫、肠袋虫等，一般寄生在后肠近肛门3～6cm的地方。
检查时除了注意发现较大型的寄生虫和在肠液中生活的寄生虫外，还应注意肠内壁上有无白色点状物或瘤状物，有无溃烂发红发紫的现象。如果有小白点，压破其孢囊，往往可以看到大量的粘孢子虫，有时也会是微孢子虫。青鱼肠里溃烂或有白色瘤状物，往往是球虫的大量寄生。如果发红发紫，则一般是细菌性肠炎。
（4）肝脏检查肝脏，同样先用肉眼观察，注意肝脏的颜色与正常鱼有无明显变化，有无溃烂、病变、白色和肿瘤等。在肝的表面，有时可发现复殖吸虫的孢囊或虫体，有的则有粘孢子虫、微孢子虫或球虫形成的孢囊的小白点。将外表观察完后，从肝上取少许组织，放在载玻片上，盖上盖玻片，轻轻压平，先在低倍镜下观察，然后再用高倍镜观察，通常在病鱼肝脏上可发现粘孢子虫，微孢子虫等的孢子或胞囊，有时还有吸虫的囊蚴。

三、鱼病的诊断
在现场调查、目检、镜检的基础上，对鱼病的原因进行综合分析，往往才能作出最后的准确诊断。在判明鱼病的原因时，除了症状很明显的外，一般还应注意是由单一病因引起的还是由多种病因引起的，若是单纯感染，则病因明确

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