动物的地理分布区系划分，历来为鱼类学家关心的中心议题之一，划分方法各抒已见，较有影响的划分方法在此仅介绍三种。

　　张春霖先生于1954年9月在地理学报上发表了“中国淡水鱼类的分布”一文，认为中国淡水鱼类区域的划分与陆生动物、植物不完全相同，应分为黑龙江、西北高原、江河平原、东洋区和怒澜区等五区较合理，并分析了各区特有鱼类或优势种类的特点。

　　1、黑龙江区
　　包括黑龙江、松花江及乌苏里江、图门江、鸭绿江各流域。区内鱼类主要群系是耐寒的种类，如圆口纲的三种七鳃鳗，鲑形目的鲑科10种、茴鱼科2种、胡瓜鱼科1种、狗鱼科1种，鳕形目的江鳕，鲟形目的史氏鲟、鳇，刺鱼目的三刺鱼等冷水性种类，均为本区特有的代表性种类。

　　2、西北高原区
　　本区包括新疆、西藏北部、内蒙古、青海、甘肃、陕西、山西等地。区内主要是高原或山地，所栖息的鱼类均具备特殊的适应条件，如能耐旱耐碱，或能栖居于急流水底，故种类比较少，虽本区各属是各区中最少者，但有些特珠适应生存环境的属，种类特别多，成为优势类群。例如裂腹鱼亚科约70种，条鳅亚科110种构成本区的特有种类。

　　3、江河平原区
　　本区为一大平原，包括长江中下游、黄河下游、淮河流域和辽河下游，区内除各江河干、支流外，还有波阳湖、洞庭湖、太湖、巢湖等大小数千湖泊，因其地势平坦、水流缓慢，主要鱼类的特殊适应特点是，一般的形状是身体侧扁，头尾均尖，略呈纺锤形，胸、腹、臀、尾鳍都很发达。鲤科的大多数种、属分布在这一区域，如鲤、鲫、鳊、草、青、鲢、鳙、赤眼鳟、鳤、鳡、鯮、鲌、鲹、飘鱼、麦穗鱼、铜鱼、棒花鱼、鳈等。本区内鲤科鱼类不但种数繁多，且其种的个体产量也很丰富，堪称为鲤科在亚洲的繁殖中心。

　　4、东洋区
　　本区包括广东、广西、海南、云南东部、贵州、福建、台湾等地，区内鱼类多属喜温暖的亚热带、热带鱼类。本区内生活于高山峻岭河川中鱼类，由于水流湍急，栖居的鱼类多在口部或胸部具有吸盘，以能在急流中生存。本区以热带性生物的种属繁多为特征。其鱼类群系组成与越南、泰国、缅甸、印度各国的情况相似，其代表性种类主要为鲤科的丹亚科、野鲮亚科、鲃亚科，平鳍鳅科，鲇形目的长臀鮠科、锡伯鲇科、芒科、粒鲇科、胡子鲇科、鮡科、鲀头鮠科等。

　　5、怒澜区
　　本区为雅鲁藏布江、怒江、澜沧江、金沙江所流经的区域，包括西藏南部和东部、四川西部、云南西部。区内河流均为南北流向，使东洋区和西北高原区的鱼类通过江水的交流而共存于本区。譬如野鲮亚科、鳅科的沙鳅属，平鳍鳅科、鲿科、鲶科的鲶属、合鳃目的黄鳝、鳢科的乌鳢等种类与东洋区相同；而裂腹鱼亚科、条鳅亚科等种类与西北高原区相同，两区鱼类的混杂是本区鱼类区系的特点。