最近几年，人们对养殖鲑鱼与野生鲑鱼究竟哪种鲑鱼对人体健康有益争论不休，而据调查显示，相对于野生鲑鱼，养殖鲑鱼含有大量的PCB，二氧(杂)芑以及其他的致癌物质，但与此同时，科学实验表明鲑鱼体内的Omega-3脂肪酸有助于减少人们患心脏病的几率。 
一家新成立的公司――Aqua Bounty公司，已经开始将基因工程用于鲑鱼中。提取海洋中大头鱼的部分遗传密码移植于鲑鱼体内，从而产生一种新的鲑鱼产品，该类大头鱼的生长速度是普通养殖鲑鱼的两倍，养殖该类新鲑鱼，成本仅是养殖普通鲑鱼的三分之一，而产量却是普通鲑鱼的两倍。公司创立者Elliot Entis坚信他们的经基因改良的鲑鱼将很快得到美国食品及药物管理局(FDA)的认证从而走入市场。 
但是从目前人们对养殖鲑鱼的各种争论来看，一旦基因改良鲑鱼进入市场，则不难想象更大的争论将会铺天盖地而来。