人工杂交是人类有目的地创造变异的重要方法，也就是使杂交亲本的遗传基础通过重组、分离和后代选择，育成有利基因更加集中的新品种，这种有性杂交结合系统选育的育种方法叫杂交育种。
　　一、杂交亲本的选择
　　1、根据育种目标选择亲本　　如果育种的主要目标是选育抗寒、抗病或起捕率高的品种，那么就必须选择一个抗寒、抗病能力强或起捕率高的品种作亲本材料。虽然杂交后代中可能出现有超越亲本的现象，但在主要育种目标的性状上，就不能完全寄托在这种超越性上，而是应该对亲本的选择提出严格的要求。在主要育种目标上靠遗传，在其他育种目标上可以靠变异。
　　2、正确分析亲本的性状及其遗传规律　　首先要了解育种性状的遗传基础是属于简单遗传，还是复杂遗传。其次，要了解选择亲本各性状之间的连锁或相关关系。
　　3、亲本间的性状要互补，优点多，缺点少，更重要的是亲本的优良性状要突出　　杂交亲本应具有较多的优点，较少的缺点，使亲本间优、缺点能够在其子代中得到互补。
　　4、选择生态类型差异或地理远缘的品种作亲本，同时还要考虑亲本对培育地环境条件的适应性　　用生态类型不同或远缘品种作杂交亲本，可以使它们的后代出现多种多样类型，比较容易从中获得符合要求的新类型。
　　5、选用配合力好的品种作亲本，且亲本材料必须纯正　　一个优良推广品种，并不一定是良好的亲本，还必须具有遗传传递力强、配合力好等条件才能成为一个有价值的亲本。
　　二、杂交育种的方式
　　1、育成杂交
　　（1）简单育成杂交　　是根据当地、当时的自然条件、生产需要以及原地方品种品质等客观因素确定的育种目标，应用相应的不同品种使它们各参加杂交一次，并结合定向选育，将不同品种的优点，综合到新品种的一种杂交育种的方法。
　　（2）级进育成杂交　　根据当地自然条件、经济条件和生产需要及原地方品种品质等客观因素确定的育种目标，引入一个相应的改良品种与当地被改良品种进行杂交，获得级进第一代杂种（级F1）。然后将此杂种再与原改良品种回交，以获得在生产性能上显着地向改良品种方面发展，并适当保留本地品种原有的某些优点。
　　（3）引入育成杂交　　此法与（2）相反，是以引F1再与当地被改良品种回交，如此各代杂种连续与当地被改良品种回交若干代，并结合定向培育，以获得生产性方面稍有某些改良的符合育种目标的理想杂种育成新品种。
　　（4）综合育成杂交法　　根据当时的自然条件、人们需要的原地方品种品质等客观因素确定的育种目标，引入相应的改良品种与当地被改良品种进行多种育成杂交的育种方法。
　　2、近交选育　　杂合体通过自交或近亲繁殖，其后代群体将有以下几方面的遗传效应:（1）杂合体通过自交可导致后代基因的分离，并使后代群体的遗传组成迅速趋于纯合化；（2）杂合体通过自交，必然导致等位基因的纯合而使隐性有害的性状表现出来；（3）杂合体通过自交可使遗传性状重组和稳定。
　　3、回交选育　　通过杂交获得的杂种F1与亲本之一再行杂交，这叫回交。回交的遗传效应有两个方面:（1）连续回交可使后代的基因型逐代增加轮回亲本的基因成分，逐代减少非轮回亲本的基因成分，从而使轮回亲本的遗传组成替换非轮回亲本的遗传组成，导致后代群体的性状逐渐趋向轮回亲本；（2）回交可以导致基因型纯合。
　　三、杂交的遗传后果
　　鱼类的杂交育种是人类赖以生存、获取蛋白质来源的重要手段，但是也应看到杂交给人类带来的不良后果。鱼类与植物、家畜等不同，它的流动性很大，且不易觉察、控制，它可以借助于雨水、晨露从一个水域进入另一个水域。一些高山湖泊、新形成的水库、水池会很快被一些鱼类占领。因此，其基因“污染”是鱼类杂交最严重的遗传后果。