随着渔业养殖密度及产量的不断提高，鱼病已逐渐成了水产业发展的主要制约因素之一，其中寄生虫病占有一定的比例。寄生虫危害严重时可引起鱼生长发育缓慢，抵抗力下降，甚至造成死亡。有时寄生虫的影响虽然并不显著，但从生产情况看，淡水鱼的细菌性疾病主要是细菌性体表病，而寄生虫造成的损伤常是这类疾病发生和流行的主要原因。因此，对寄生虫的危害应引起高度重视。目前防治鱼寄生虫病主要可采取以下措施。
　　科学管理  鱼病防重于治。首先养殖池塘要彻底清塘，排干池水，每亩用块状生石灰100～150公斤化浆全池泼洒；对种苗实行检疫制度，不放养携带病原体的鱼种鱼苗，鱼种入池前用200毫克/升高锰酸钾溶液浸泡30分钟；养殖期间，每个月全池泼洒一次鱼用敌百虫溶液，对饲料等生产投入品要严格控制质量与数量，以防污染水体。采取科学规范养殖措施进行健康养殖、生态养殖，提高鱼自身免疫力，降低发病率，减少渔药使用；推广养殖抗病品种。
　　化学药物治疗  常用于防治鱼寄生虫病的化学药物主要有硫酸铜、硫酸亚铁、碘、高锰酸钾、敌百虫和硫双二氯酚等。危害严重的寄生虫病一般可分为两大类，一是单细胞原生动物寄生虫，主要有鞭毛虫、肉足虫、孢子虫、纤毛虫和吸虫；二是多细胞后生大型寄生虫，主要有蠕虫、甲壳动物和钩介幼虫。应根据它们不同的机体结构，选用不同的药物。原生动物寄生虫是单细胞低等动物，常用渔药中的硫酸铜、硫酸亚铁、碘、高锰酸钾和甲醛等即可杀灭；而大型寄生虫器官分化较完全，杀灭此类寄生虫常用敌百虫和硫双二氯酚等。
　　中草药治疗  中草药是一种理想的天然、环保型绿色药物，具有高效、毒副作用小、安全性高、残留少等诸多优点，且来源广、成本低，在目前全面提倡健康养殖的新形势下，应用中草药防治鱼病具有广阔的前景。目前，常用于防治鱼寄生虫病的中草药有苦楝、大蒜、百部、槟榔、南瓜子、苦参、大黄和黄芩等。虽然中草药的疗效是肯定的，但在鱼病大规模暴发时，短期内大量使用往往效果不佳，因此，对其进行深加工就显得尤为必要。故应借助中草药学研究方法对渔用中草药的成分、性质、药效和药理进行系统研究，探索渔用中草药有效成分的提取方法及新剂型的研制及最佳使用方法，使其更好地服务于现代化渔业的生产与发展。这方面已经有人进行了大胆探索，如外用新灭虫灵Ⅰ号和Ⅳ号、鱼虫克星等药物取得高效、速效的效果。另外，为了提高疗效，减少抗药性和毒副作用，可采用中西药结合，如敌百虫、溴氰菊酯、苦参碱进行交叉使用。