七彩神仙疾病呈多样性、特殊性和普遍性，归纳为两方面:一是生物源致病，如病毒细菌，立次体、霉菌、原虫等。二是非生物性致病，如非离子氨氮NH3—N，氢氧化铵NH4OH、硫化氢H2S，有机磷和有机氮等。这是七彩神仙鱼致病的主要原因，其常现疾病有:
　　一、病毒病
　　1.传染性血组织坏死病:病原体是传染性造血组织坏病毒，所引起的病理变化会导致多器官的损害，如鳃、肝、胰腺、心脏、性腺、血细胞等。病鱼鳃出现苍白色，体色变暗、眼球突、腹水、口腔出现瘀点、粪便管型、背鳍区和一些鳍基部的骨胳肌中有出血区。幼鱼出现全身系统的血外渗现象，死亡率相当高。
　　2.病毒性出血性败血疾病:病原体是出血性败血疾病毒，所引起的病理变化为:急性期、慢性期和神经期疾病。急性期表现为，患鱼体色变暗、单侧眼球突出、盆血和眼、胸、鳍基部出血。慢性期表现为，双侧性眼球突出、重度盆血、体色显着变暗、偶见积水。神经期表现为，出现呆滞、快速螺旋式打圈和不规则的游泳行为，后期偶见针腹壁内缩现象，体内损害有骨胳骨肉和整个内脏组织出现许多点状血液外渗及出血，肾脏常见肿胀，表面稍起伏不平并呈灰色。
　　3.传染性胰腺坏死病:病原体是传染性胰腺坏死病毒。该病毒常侵袭幼鱼，发病特征通常是鱼体作瓶塞钻样盘旋或反轴状旋转，伴有眼球突出，腹水，体表变暗和腹鳍基部出血，内脏的肝脾通常颜色变浅，消化道内没食物，在胃和前肠内往往有一透明或不透明的黏液栓，在盲肠和胰腺组织区也可以发生瘀点。
　　4.黑死病:病原体不明，与病毒感染关系密切，有传染性。发病初期，鱼体感觉不舒，身体发黑，喜躲在一角，怕光，上下鳍有时不断振动，象畏寒感觉，病重时速环迭式排列，发出臭腥味。病因可能是病原体入侵鱼体时，使鱼真皮中的载黑素细胞增多，并促使大量的黑素体成熟。当鱼的病情加重时，鱼的神经或体液调节失控，使这些黑素释放到体表黏液中。七彩神仙表现为身体发黑，腥臭非常。当鱼重病时，鱼只极度虚脱，内脏器官有不同程度的萎缩，但未见有实质性的病理变化。
　　二、细菌性疾病
　　1.溃疡病:病原体是鱼嗜血菌，属菌血症性疾病。以急性皮肤溃疡为特征，溃疡损害只限于皮肤，骨胳和骨头。这种病在溃疡形成之前有增生性表皮改变和无继续性真菌侵染，头部和口头皮肤是易染区，溃疡区多为圆形，直径达1cm，颔头的溃疡形成可延及其下的骨头，造成骨毁损。鳍条间软组织也可被破坏，坏死区的近缘往往有一条清楚的白色组织线。
　　2.出血性败血病（水肿病）:病原体是一种引起全身性疾病的液化气单胞菌，特征表现为皮肤溃疡形成，腹水和重要器官（如肝、脾、肾等）的坏死。其中潜隐型无外表征象，仅可有离群独游和泳动无力等行为方式改变。急性腹水型:由眼球突出和肛门突出而明显。慢性溃疡型:皮肤有溃疡，往往累及肌肉组织，组织损害有黄色与浆液血红色的腹水液，腹膜和内脏黏连，脾肿大，肠充血，偶有瘀点及近黄色至绿色的肝变色，脂肪变性及凝固性和干酪性坏死，血管炎和肝硬变等。
　　3.细菌性鳃病:病原体是噬胞菌，是一种增生性病变，特征为鳃小片上皮组织肥大和增生。这类细菌当水体中氨（亚摩尼阿（的含量在0·5～1·5ppm时，及低溶氧4·0～5·0ppm时，增值速度相当快，会造成疾病加重及蔓延。
　　三、真菌性疾病
　　1.鳃霉病:病原体是血霉和穿移鳃霉，该菌有一套独立的生存方式，它能在鱼的血管内生长而能引起鱼鳃的病性，局限性真菌感染。鳃霉产生无横隔的分枝菌丝和内孢子菌丝，孢子能生活在无寄主的水中，可直接侵入鱼体或被鱼摄食，后经肠淋巴管入血循环，最后在鳃血管内萌发，造成病灶及形成血栓，引起局部缺血性出血区，以及周围的变白坏死斑，造成鳃小片上皮细胞增生和鳃小片融合。当鳃丝血管内发生大量增生时，鳃丝即明显增厚，覆盖于增厚鳃丝区上的鳃小片和那些为菌丝所穿透的鳃小片，往往有增生和肥大的上皮覆盖细胞在血管穿透外，有血管周围出血，成纤维细胞增生和象原始网状内皮细胞，具有大的泡状核和灰白色周界不清的胞质的单核细胞的积聚。
　　2.鱼霉病:病原体是一种能引起全身性内芽肿性感染的霍弗鱼霉，该菌有一套较为复杂的生活史，当该菌孢子被鱼吞入，萌发后穿移入肠壁，形成新的菌丝体，或孢子进入血流散布全身，在其他器官及组织中萌发，从而形成病灶。该菌有三个基本阶段:一是孢子或休眠期:孢子大小为10～2

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